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利用ISSR标记对59份山楂材料进行了遗传多样性分析。从51条引物中筛选出15条,用于山楂的ISSR扩增,共扩增出122条带,其中多态性条带113条,多态性为92.62%。根据ISSR扩增结果,利用DPS软件进行分析,通过UPGMA对59份材料进行聚类分析,认为伏山楂为山楂属的一个独立种,与山楂亲缘关系较近。同时,探讨了我国北方分布的山楂属植物的亲缘关系。