哈茨木霉Th-33全基因组序列测定与分析

• 作 者: 孙青 蒋细良 庞莉 王丽荣 李梅
• 机 构: 中国农业科学院植物保护研究所/农业部作物有害生物综合治理重点实验室
• 出 处: 中国生物防治学报
• 发表日期: 2016年2期
• 关键词: 哈茨木霉 基因组 基因注释 代谢通路 重寄生相关基因 Trichoderma harzianum whole genome gene annotation
• 基金项目: 国家自然科学基金（31371983,31071728）

利用Hiseq2500高通量测序平台对哈茨木霉Th-33全基因组进行序列测定,获得196个scaffolds,共预测了10849个基因,平均长度为1776 bp（Gen Bank登录号：PRJNA272949）。以GO（gene ontology）数据库对预测出的基因做基因注释,共注释基因6238个;以KEGG（kyoto encyclopedia of genes and genomes pathway database）数据库对预测出的基因做基因注释,有6789个基因注释到279条KEGG代谢途径。K