【摘 要】
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本研究对岩白菜转录组测序获得的94 755条Unigene用MISA软件进行SSR位点挖掘和分析,共获得10 237个SSR位点,SSR出现频率为10.80％,所有的SSR位点分布于9 001条Unigene上,发生频
【机 构】
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云南农业大学农学与生物技术学院,昆明,650201;云南农业大学园林园艺学院,昆明,650201
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本研究对岩白菜转录组测序获得的94 755条Unigene用MISA软件进行SSR位点挖掘和分析,共获得10 237个SSR位点,SSR出现频率为10.80％,所有的SSR位点分布于9 001条Unigene上,发生频率为9.50％;二核苷酸(72.31％)分布最多,其次是三核苷酸(22.29％),主导的重复基元类型是AG/CT.利用Primer 5.0进行引物设计,随机筛选100对引物进行验证,有60对可以扩增出与预期大小相符的条带,且多态性较好.结果 表明基于岩白菜转录组序列开发SSR标记是可行的,这些SSR引物的开发有助于岩白菜的遗传多样性分析和分子标记辅助育种.
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