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荧光原位杂交(FISH)是原位杂交技术的一种，即不需要预先分离核酸，在杂交的过程中不改变核酸的位置，不仅可以检测靶序列存在与否，还可以显示其存在的位置。FISH技术是将组织或细胞标本固定于玻片上后，将荧光标记的探针与待测标本的核酸进行原位杂交，在荧光显微镜下对荧光信号进行辨别和计数，从而对染色体或基因异常的细胞、组织标本进行检测和诊断。荧光原位杂交常用的荧光标记物有AMCA(蓝色荧光)、FITC(绿色荧光)、罗丹明(红色荧光)、德州红(深红色荧光)、Cy3(不可见红外光)及Cy5(同前)，其中Cy3和Cy5的荧光强度最高且稳定，适用于检测低丰度标本的检测。