利用PLS—VIP方法筛选差异表达基因

• 作 者: 韩放 吴晶辰 徐江峰 邓明华
• 机 构: 北京大学数学科学学院,北京大学理论生物学中心
• 出 处: 北京大学学报：自然科学版
• 发表日期: 2009年1期
• 关键词: 微阵列 差异表达基因 降维 PLS-VIP microarray differentially expressed genes reduction of
• 基金项目: 北京大学校长基金,国家自然科学基金（30570425）,国家高技术研究发展计划专项经费（2006AA02Z331,2008AA02Z306）,国家重点基础研究发展计划（2003CB715903）和微软亚洲研究院资助

提出一种基于变量权重寻找差异表达基因的新方法。该方法的最终目的是从微阵列数据中抽取出核心变量（基因）。将该种方法抽取出的差异表达基因判别样本的能力和普通的PLS方法以及判别最小二乘方法进行比较，结果表明该方法的错误率明显低于其他两种传统方法。因此，PKS—VIP方法是一种较为合适的抽取差异表达基因并判别样本的方法。