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高效毛细管电泳（HPCE）是近年发展起来的一项新型分析技术，在现代中药研究中得到广泛应用。可利用HPCE技术对植物药的根、茎、叶、花、果实、种子和动物药等中药进行定性鉴别，尤其是对不同地区，同属不同种的植物种源的鉴别，具有较强指导意义。在中药有效成分的测定，如对含生物碱、黄酮类、苷类、有机酸类、醌类、酚类、蛋白质多肽类、多糖类的植物药测定方面，HPCE技术具有分析时间短、进样量少、有机溶剂消耗少等优点。HPCE技术还具有对中药复方制剂多组分可同时测定的优势，也应用于中药毒性成分及非法添加化学成分的控制。H