【摘 要】
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应用MassARRAY单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(matrix assisted laser desorption/ionization time of flight mass
【机 构】
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四川省畜牧科学研究院,成都 610066;动物遗传育种四川省重点实验室,成都 610066;四川省成都市农林科学院畜牧研究所,成都 611130
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应用MassARRAY单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(matrix assisted laser desorption/ionization time of flight mass spectrometry,MALDI-TOF-MS)基因分型法检测肉兔胰岛素样生长因子1 受体(Insulin-like Growth Factor 1 Receptor,IGF-IR)的多态性(SNPs),为今后建立肉兔辅助标记选择奠定基础.以家兔IGF-IR基因序列为模板,利用PCR扩增测序法筛查了肉兔IGF-IR基因的9个SNPs.为进一步验证筛选的准确性,应用MALDI-TOF-MS针对384只肉兔检测了5个SNPs.结果显示,平均检出率为98％,能够准确检测出3种常见的基因型.所检SNP位点的平均最小等位基因频率(MAF)为0.45,平均多态信息含量(PIC)为0.36.本研究运用的方法快速、可靠、准确度高,为以后开展肉兔生长性状基因的SNP分型和检测等奠定了基础.
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