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东昆仑水闸东沟─黄龙沟金矿位于柴达木盆地南缘,介于昆中、昆北两深大近东西向断裂带之间。矿区发育的北西向大型左行韧性剪切带是萤石沟─红旗沟脆韧性剪切带的中间部分,韧性变形叠加在加里东花岗岩、印支期花岗岩和上元古界青白口系变火山组板岩之上,并伴随着强烈的绢云母化和硅化。金矿体由蚀变斜长花岗岩和板岩组成,严格受韧性剪切带控制,其产状与韧性剪切带产状一致。矿石体现三个成矿阶段的特征,第一阶段矿物呈具透入性、弥散性的特征,与韧性变形同步,局部沿糜棱面理聚集成细脉,主要组成矿物为石英、长石、绢云母、毒砂、黄铁矿、磁黄