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塔里木盆地东部及周缘坳陷的中、下侏罗统煤层发育，库车坳陷和塔北局部地区有三叠系煤层（线）。它们可能是盆地的主要陆相烃源岩。煤样的三环萜烷、五环三萜烷和甾烷等饱和烃生物标志物和芳香烃化合物有特殊的组成和分布，陆源高等植物生源和氧化性沉积环境特征明显。它们的烷基环己烷和烷基苯系列化合物丰富，表明细菌是煤中有机质的重要组成部分。