表达谱芯片对EB病毒诱导甲基化沉默基因的筛选

• 作 者: 王菁 刘霞 韩美艳 吴国才 王云 罗兵
• 机 构: 青岛大学医学院微生物学教研室,青岛市妇女儿童医疗保健中心遗传科
• 出 处: 青岛大学医学院学报
• 发表日期: 2012年4期
• 关键词: 疱疹病毒4型 人 甲基化 基因 肿瘤抑制 寡核苷酸序列分析 herpesvirus 4 human methylation genes tumor sup

目的筛选EB病毒（EBV）相关胃癌中大量EBV诱导的甲基化沉默基因，为EBV相关肿瘤的研究提供理论依据。方法采用Agilent人类全基因组表达谱（4×44K）芯片，检测去甲基化药物Aza作用前后的EBV阳性和阴性胃癌细胞株，筛选出EBV相关胃癌特有的甲基化沉默基因。应用实时荧光定量PCR和亚硫酸盐测序（BGS）方法对结果进行验证。结果去甲基化药物作用前后的EBV阳性细胞系差异基因与EBV阳性与阴性胃癌细胞系差异基因的共同基因共68条，此为EBV相关胃癌甲基化沉默特异性基因。在差异倍数为1．5和2