基于DIA LC-MS对Ⅲ期食管鳞癌和食管良性疾病患者外周血外泌体差异蛋白的研究

来源 :新疆医科大学学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:dlfb
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目的 研究Ⅲ期食管鳞癌(esophageal squamous cell carcinoma,ESCC)患者与食管良性疾病患者外周血外泌体蛋白组学的差异.方法 基于数据非依赖性采集高分辨率色谱-质谱技术(data independent acquisition liquid chromatography-mass spectrometry,DIA LC-MS),比较3例Ⅲ期ESCC患者与3例食管良性疾病患者外周血外泌体蛋白种类的差异,并对这些差异蛋白进行生物信息分析.结果 通过透射电镜、纳米粒子示踪分析、免疫印迹法鉴定提取粒子为外泌体,在2组样品中共检测到1018个蛋白.通过对比蛋白图谱,共发现21个差异蛋白.富集分析结果表明功能组分中主要涉及细胞黏附和代谢,细胞组分中主要是胞质成分.而在分子功能中涉及多个酶活性.在对这些差异蛋白进行京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析后显示:叶酸代谢通路、核糖体蛋白质等代谢过程有差异.结论 基于DIA LC-MS技术对Ⅲ期食管鳞癌患者和食管良性疾病患者外泌体差异蛋白分析显示,代谢通路可能在食管癌发生发展中发挥重要作用.
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