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淡水养殖池塘水体是一个相对封闭的生态系统，也是一个脆弱而易于调控的生态系统。环境中非生物因子（温度、光照、残饵及鱼虾排泄物积累等）首先影响到其中微生物群落的演替变化，而微生物群落的改变又反过来影响养殖水质和养殖动物的质量。在南美白对虾虾塘环境中，由施肥、投饵及虾的排泄物造成的污染相当严重，是导致虾类生长缓慢、饲料系数增高、中毒、发病甚至死亡的重要原因。