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海洋主体功能区划，是基于主体功能区划理论的一个新的应用尝试，有许多新的问题值得探索。论文在辨析海洋主体功能区划与海洋功能区划之间关系的基础上，从基本概念、基本原则、基本层级、基本路径四个方面探讨海洋主体功能区划的基本问题，明确了海洋主体功能区划的基本概念，提出了尊重自然、推进国家战略、区域统筹的区划原则，确定了海洋主体功能区划体系层级等问题，分别设计出了内水和领海海域、海岛区域、专属经济区和大陆架的主体功能区划路径。