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南方水稻黑条矮缩病自2011年在红河州采样经检验鉴定发生，通过2011—2016年该病的发生实况，结合当地白背飞虱灯诱及田间调查情况，分析该病在当地的发生并不单一受传毒介体-白背飞虱发生量大小、带毒率高低影响，还与品种抗性、水稻品种敏感生育期、气候条件、播种时间、栽培技术、地形地貌等因素密切相关，并提出培育无病秧苗、清除病株、治虫防病等相关防控措施。