长链非编码RNA在人退变椎间盘组织中的基因表达谱

• 作 者: 孙中仪 晏鹏 王圣杰 梁鹤 李洋 王德国 田纪伟
• 机 构: 201600 上海交通大学附属第一人民医院松江分院 上海市松江区中心医院骨科,上海交通大学附属第一人民医院骨科,上海交通大学附属第一人民医院骨科,201600 上海交通大学附属第一人民医院松江分院 上
• 出 处: 中华医学杂志
• 发表日期: 2017年97期
• 关键词: 椎间盘 细胞衰老 基因表达 髓核细胞

目的

探讨长链非编码RNA(lncRNA)在椎间盘退变(IDD)的表达情况。

方法

应用人髓核(NP)组织的lncRNA－mRNA芯片。采用生物信息学方法来预测描绘差异性表达的lncRNA的功能及作用。并选择部分lncRNAs和mRNA用于定量实时聚合酶链反应(qRT－PCR)验证。

结果

在退变椎间盘组织中有差异性表达的总共1 570个lncRNA。其中，428个lncRNA的表达水平与正常椎间盘组织相比上调>2倍，而584个的表达水平下调。生物信息学分析(GO分析和KEGG生物学通路分析)显示，参与调节细胞外基质和凋亡的一些典型途径在这些细胞中异常表达(P<0.05)。分析增强子样的lncRNA及其附近的编码基因，确定3个lncRNAs为潜在的增强剂。RT－qPCR在退变髓核组织中验证了lncRNA的存在。

结论

lncRNAs参与椎间盘退变的进展。LncRNA可能是新的候选生物标志物和椎间盘退变潜在的治疗靶标。