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早在20世纪50年代。中国热带农业科学院（原华南热带作物研究院）就已开始收集芒果种质资源。2005年初步建成芒果种质资源圃。农业部儋州芒果种质资源圃于2009年3月授牌。挂靠在中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所。从2006年到2009年。资源圃面积增加到2公顷。2009年，新建田间实验室4间（140平方米）。完成塑料大堋1360平方米的改造。