杂交石斑鱼和母本褐点石斑鱼转录组测序及差异表达基因分析

• 作 者: 林明德 陈刚 马骞 王忠良 张健东 谢瑞涛 汤保贵 黄建盛
• 机 构: 广东海洋大学水产学院,广东恒兴饲料实业股份有限公司,广东粤海饲料集团公司
• 出 处: 广东海洋大学学报
• 发表日期: 2019年3期
• 关键词: 褐点石斑鱼 杂交石斑鱼 转录组测序 比较分析 生长相关基因 Tiger grouper hybrid grouper transcriptome compara
• 基金项目: 2016广东省省级科技计划项目“石斑鱼杂交新品种选育”(2016B020201009).

【目的】筛选褐点石斑鱼(Epinephelus fuscoguttatus)及其杂交子一代(E. fuscoguttatus♀×E. polyphekadion♂,F1)的差异表达基因,探讨褐点石斑鱼及F1代之间的生长差异性。【方法】采用Illumina HiSeq 2000测序平台对同龄的褐点石斑鱼及其杂交F1的脑、肝脏和肌肉组织进行转录组测序,通过edgeR软件包筛选差异表达基因,并对差异表达基因进行GO(Gene Ontology)功能注释和KOG注释,最后通过实时荧光定量PCR验证转录组