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华中农业大学农业微生物学国家重点实验室成立于2003年11月，隶属于国家科技部。该实验室是在陈华癸院士等老一辈科学家创建的微生物学科基础上发展起来的。1996、1999、2002年连续三次被国家农业部评为优秀(A级）实验室，连续两次被国家农业部推荐参加国家重点实验室评估．在参加全国生命科学类国家重点、部门开放实验室评估中成绩良好。2003年升格为国家重点实验室。