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目的 探讨荧光原位杂交法(FISH)与免疫组织化学法(IHC)检测乳腺癌人表皮生长因子受体-2(HER2)基因扩增与蛋白表达的差异性.方法 选择2018年12月-2019年12月在我院进行诊断的52例乳腺癌患者作为本次研究对象.并分别采用FISH与IHC法检测本研究乳腺癌患者的HER2基因扩增与蛋白表达.随后比较FISH检测结果与IHC阴性(0～1+)、IHC阳性(3+)检测结果的一致性与差异性.结果 除去IHC检测结果不确定病例,FISH与IHC检测结果的总符合率为90.63％(29/32),两种检测方法具有较高的一致性,并存在统计学意义(P=0.00);其中IHC检测病例中,两种方法阳性检测一致率为88.89％(16/18),阴性检测一致率为92.86％(13/14).结论 FISH与IHC检测方法对乳腺癌HER2表达具有较高的一致性,且FISH检测法的稳定性更好.但同时注意HER2蛋白表达为(2+)病例时,需通过FISH检测HER2基因扩增情况.