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利用已克隆的Pigm基因的核酸序列在基因功能区设计新引物,鉴定到不育系材料FD1712的功能区序列差异,开发了基于PCR的新的插入/缺失(insert-deletion,InDel)标记,标记与基因功能紧密连锁。通过扩增和电泳检测,表明引物扩增稳定;通过稻瘟病菌的接种鉴定,表明新开发的标记能有效鉴别稻瘟病抗性,可用于分子标记辅助育种。