贵州省PCV2流行株的分型及遗传变异分析

• 作 者: 吴好叶 徐国 梁海英 曾智勇 汤德元 王彬 黄涛 张爱琼 何
• 机 构: 贵州大学动物科学学院,贵州省兴义市农村工作委员会
• 出 处: 中国兽医杂志
• 发表日期: 2018年7期
• 关键词: PCV2d 基因型 ORF 生物信息学 PCV2d Genotype ORF Bioinformatics
• 基金项目: 国家自然科学基金资助项目（31560688）

为了解贵州省猪圆环病毒2型（PCV2）的分子流行病学及遗传变异情况,本文收集2012-2016年间16株贵州PCV2流行毒株和NCBI上报道登录的35株PCV2序列作生物信息学分析。分析结果显示,在本次所分析的各PCV2毒株之间核苷酸变异率较大的分别为ORF6（32. 22%）、ORF10（29. 63%）、ORF2（24. 11%）、ORF5（21. 60%）、ORF7（20. 00%）;遗传进化表明,贵州省16株PCV2序列中3株为PCV2a型,5株为PCV2b型,8株为PCV2d型;其中PCV2d型