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用筛选出的6个ISSR适宜引物，对产于内蒙古通辽、包头与巴彦淖尔地区的罗布麻遗传多样性进行分析，共扩增出ISSR位点65个、多态性位点55个，多态性位点比例为84．62％。内蒙古地区罗布麻ISSR总遗传多样性指数为0．424，居群内为0．197，居群间为0．227，居群间的遗传分化系数为53．54％。以相异系数0．44为基准分为2类：通辽地区的种质材料聚为1类，地理位置相距较近的巴彦淖尔地区和包头地区的种质材料聚为另1类，包头和巴彦淖尔地区罗布麻种质资源的亲缘关系较近。聚类结果与材料的来源地有一定的相关性