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系统性红斑狼疮（SLE）的治疗仍是一个挑战，美国FDA已经超过40年没有批准新的治疗方案。每月注射1次的环磷酰胺（口Ⅸ），连续使用6个月是目前治疗狼疮肾炎标准的诱导方案，随后的维持阶段是每3个月使用1次，共2年。但是长期暴露于CTX可能会出现包括感染、骨髓损伤、恶性肿瘤、出血性膀胱炎和卵巢功能早衰等副反应。而其他的疗法如霉酚酸酯并不更有效或更安全。