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【摘要】 目的 探讨不同PCR扩增试剂盒在血样DNA中的检验及对比结果。方法 抽取320例血样DNA作为检测对象,并应用不同PCR扩增试剂盒进行检测,在此基础上,结合所得的血样检验结果进行分析比较。结果 经研究,在样本相同的情况下,血样检验差异率为1.25%(4/320)。而且经检测,4例出现不同检验分型的样本均存在等位基因缺失。另外,Profiler PlusTM扩增不平衡发生率为0.9375%,IdentifilerTM扩增不平衡发生率为0.3125%,Powerplex 16HS扩增不平衡发生率为0.3125%。结论 在血样DNA的检验过程中,通过应用不同PCR扩增试剂盒进行检测,能够准确获取到不同位置的异常基因,减少基因缺失、扩增不平衡所带来的误差影响,具有较高的推广价值。
【关键词】 PCR扩增试剂盒;血样DNA;检验;扩增不平衡;基因缺失
doi:10.3969/j.issn.1004-7484(s).2013.11.834 文章编号:1004-7484(2013)-11-6808-02
聚合酶链式反应(PCR)是常用于基因分离、克隆及DNA或RNA检测的一种体外酶促合成特异DNA片段技术[1]。在当前,随着现代医疗技术的不断发展,以及DNA血样检验技术在检验医学中的应用日趋于普遍,使得不同PCR扩增试剂盒在实际检验中显露出越来越明显的结果差异。为此,本研究拟结合不同PCR扩增试剂盒检验血样DNA的结果进行讨论,现具体报道如下。
1 资料与方法
1.1 一般资料
1.1.1 研究对象 本研究抽取我院数据库积累的320例汉族血样作为研究对象,其中,男性为219例;女性为101例。年龄均在22岁到69岁之间,平均年龄(40.1±2.2)岁。而且经了解,全组320例血样均不存在血缘关系。
1.1.2 仪器选用 仪器选用美国ABI公司生产的9800型PCR扩增仪,以及该公司生产的3500型基因分析仪。
1.1.3 硅珠法资料 硫氰酸胍能够使蛋白质与DNA充分分离,在硅珠吸附前高速离心可以将变性的蛋白质及一些不溶的物质除去。吸附后的漂洗过程则可将溶液中的PCR抑制物洗去。高浓度的硫氰酸胍条件下,DNA能够被SiO2特异性吸附,若无硫氰酸胍存在,DNA则可重新释放出来。
1.2 方法 采用硅珠法提取血样中的DNA。按照相关要求,将PCR扩增仪反应体系设置为10μL,其余(如成份、热循环参数设置等)按照仪器说明书进行严格设置和操作。试剂盒主要选用Powerplex 16HS,以及Profiler PlusTM和IdentifilerTM等3种,用于分列出等位基因。具体按照0.05ng、0.075ng和1-8ng的剂量,分别用于扩增并检验血样DNA。
2 结 果
经研究,本组320例血样中,相同样本的检验差异率为1.25%(4/320)。而且经检测,4例出现不同检验分型的样本均存在等位基因缺失。另外,Profiler PlusTM扩增不平衡发生率为0.9375%,IdentifilerTM扩增不平衡发生率为0.3125%,Powerplex 16HS扩增不平衡发生率为0.3125%。
3 讨 论
Powerplex 16HS、Profiler PlusTM以及IdentifilerTM等试剂盒是医学领域上经常用到的3种遗传标记系统[4]。一般在采用PCR扩增试剂盒对血样DNA进行检验时,往往会由于选用的试剂盒不同,而出现被检测异常基因的位置不同的情况,且基因缺失、扩增不平衡等两种是其主要的表现形式[2]。不过据有关资料显示,Profiler Plus试剂盒在所有PCR扩增试剂盒当中,出现异常的百分比相对要高得多[5]。在本组320血样研究中,经不同PCR扩增试剂盒检验,4例出现不同检验分型的样本均存在等位基因缺失。另外,Profiler PlusTM扩增不平衡发生率为0.9375%,IdentifilerTM扩增不平衡发生率为0.3125%,Powerplex 16HS扩增不平衡发生率为0.3125%。
应用PCR扩增试剂盒检验血样DNA时,应尽可能选用同一类型且具有较低异常百分比的试剂盒进行检验。并可通过相互检验的方式,来进一步降低重要判型过程中的错判率[4]。本组相同样本存在的检验差异率为1.25%。
经本研究表明,在血样DNA的检验过程中,通过应用不同PCR扩增试剂盒进行检测,能够准确获取到不同位置的异常基因,减少基因缺失、扩增不平衡所带来的误差影响,具有较高的推广价值。
参考文献
[1] 周翼,吴林军.不同PCR扩增试剂盒检验血样DNA的结果对比分析[J].中国医药科学,2012,04(15):263-264.
[2] 柳天天.几种常用PCR扩增试剂盒检验血样DNA的结果比较[J].中外医疗,2012,05(01):174-175.
[3] 王秋平,陈斌,张琼,雷秀霞,周小棉,匡艳华.3种免核酸提取PCR试剂盒检测乙型肝炎患者血清中HBV DNA的比较[J].广东医学,2011,09(10):1035-1036.
[4] 吴微微,郝红蕾,林锦锋,等.3种国产化试剂盒与IdentifilerTM试剂盒检验结果比较[J].中国法医学杂志,2011,04(01):94-97.
【关键词】 PCR扩增试剂盒;血样DNA;检验;扩增不平衡;基因缺失
doi:10.3969/j.issn.1004-7484(s).2013.11.834 文章编号:1004-7484(2013)-11-6808-02
聚合酶链式反应(PCR)是常用于基因分离、克隆及DNA或RNA检测的一种体外酶促合成特异DNA片段技术[1]。在当前,随着现代医疗技术的不断发展,以及DNA血样检验技术在检验医学中的应用日趋于普遍,使得不同PCR扩增试剂盒在实际检验中显露出越来越明显的结果差异。为此,本研究拟结合不同PCR扩增试剂盒检验血样DNA的结果进行讨论,现具体报道如下。
1 资料与方法
1.1 一般资料
1.1.1 研究对象 本研究抽取我院数据库积累的320例汉族血样作为研究对象,其中,男性为219例;女性为101例。年龄均在22岁到69岁之间,平均年龄(40.1±2.2)岁。而且经了解,全组320例血样均不存在血缘关系。
1.1.2 仪器选用 仪器选用美国ABI公司生产的9800型PCR扩增仪,以及该公司生产的3500型基因分析仪。
1.1.3 硅珠法资料 硫氰酸胍能够使蛋白质与DNA充分分离,在硅珠吸附前高速离心可以将变性的蛋白质及一些不溶的物质除去。吸附后的漂洗过程则可将溶液中的PCR抑制物洗去。高浓度的硫氰酸胍条件下,DNA能够被SiO2特异性吸附,若无硫氰酸胍存在,DNA则可重新释放出来。
1.2 方法 采用硅珠法提取血样中的DNA。按照相关要求,将PCR扩增仪反应体系设置为10μL,其余(如成份、热循环参数设置等)按照仪器说明书进行严格设置和操作。试剂盒主要选用Powerplex 16HS,以及Profiler PlusTM和IdentifilerTM等3种,用于分列出等位基因。具体按照0.05ng、0.075ng和1-8ng的剂量,分别用于扩增并检验血样DNA。
2 结 果
经研究,本组320例血样中,相同样本的检验差异率为1.25%(4/320)。而且经检测,4例出现不同检验分型的样本均存在等位基因缺失。另外,Profiler PlusTM扩增不平衡发生率为0.9375%,IdentifilerTM扩增不平衡发生率为0.3125%,Powerplex 16HS扩增不平衡发生率为0.3125%。
3 讨 论
Powerplex 16HS、Profiler PlusTM以及IdentifilerTM等试剂盒是医学领域上经常用到的3种遗传标记系统[4]。一般在采用PCR扩增试剂盒对血样DNA进行检验时,往往会由于选用的试剂盒不同,而出现被检测异常基因的位置不同的情况,且基因缺失、扩增不平衡等两种是其主要的表现形式[2]。不过据有关资料显示,Profiler Plus试剂盒在所有PCR扩增试剂盒当中,出现异常的百分比相对要高得多[5]。在本组320血样研究中,经不同PCR扩增试剂盒检验,4例出现不同检验分型的样本均存在等位基因缺失。另外,Profiler PlusTM扩增不平衡发生率为0.9375%,IdentifilerTM扩增不平衡发生率为0.3125%,Powerplex 16HS扩增不平衡发生率为0.3125%。
应用PCR扩增试剂盒检验血样DNA时,应尽可能选用同一类型且具有较低异常百分比的试剂盒进行检验。并可通过相互检验的方式,来进一步降低重要判型过程中的错判率[4]。本组相同样本存在的检验差异率为1.25%。
经本研究表明,在血样DNA的检验过程中,通过应用不同PCR扩增试剂盒进行检测,能够准确获取到不同位置的异常基因,减少基因缺失、扩增不平衡所带来的误差影响,具有较高的推广价值。
参考文献
[1] 周翼,吴林军.不同PCR扩增试剂盒检验血样DNA的结果对比分析[J].中国医药科学,2012,04(15):263-264.
[2] 柳天天.几种常用PCR扩增试剂盒检验血样DNA的结果比较[J].中外医疗,2012,05(01):174-175.
[3] 王秋平,陈斌,张琼,雷秀霞,周小棉,匡艳华.3种免核酸提取PCR试剂盒检测乙型肝炎患者血清中HBV DNA的比较[J].广东医学,2011,09(10):1035-1036.
[4] 吴微微,郝红蕾,林锦锋,等.3种国产化试剂盒与IdentifilerTM试剂盒检验结果比较[J].中国法医学杂志,2011,04(01):94-97.