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目的：分析中西医结合治疗功能性消化不良的临床应用。方法：收集我院2012年～2014年治疗的116例功能性消化不良患者，随机分成对照组和观察组，每组58例。对照组采用的是西医治疗，观察组采用中西医结合治疗方式。对2组患者治疗前后的临床疗效进行对比。结果：观察组患者经过治疗之后显效54例，有效3例，无效1例，治疗总有效率98．28％。对照组显效48例，有效2例，无效8例，总有效率86．21％。观察组明显高于对照组。2组之间差异具有统计学意义（P＜0．05）。对照组在经过治疗之后有3例患者出现恶心等不良反应，观察组患者并没有出现相关不良反应。2组间不良反应发生无统计学意义（P＞0．05）。结论：采用中西医结合方式治疗功能性消化不良临床效果显著。能够有效的调节脾胃功能，改善胃运动功能。提升患者的生活质量，控制不良反应发生几率，值得临床进一步推广使用。