青藏高原东南部山丹nrDNA ITS和cpDNA petB/petD序列的分子进化特点

• 作 者: 蒋福娟 唐楠 唐道城 巨秀婷 孙静清
• 机 构: 青海大学高原花卉研究中心/青海省园林植物与观赏园艺重点实验室,青海省高原作物种质资源创新与利用国家重点实验室培育基地,大通县林业局,西宁市人民公园
• 出 处: 植物研究
• 发表日期: 2018年1期
• 关键词: 青藏高原东南部 山丹 ITS petB/petD 分子进化
• 基金项目: 国家自然科学基金项目31660582(Genetic mapping of resistance gene for tulip breaking virus);青海省“高端创新人才千人计划”;中国科学院“西部之光”人才培养计划~~

采用改良CTAB法提取青藏高原东南部山丹25个居群所有个体的基因组DNA，选取核基因ITS和叶绿体petB/petD区域进行PCR扩增、纯化和测序。对所有序列对位排列，其中ITS序列总长696bp，变异位点有4处，共产生7种单倍型，变异位点百分率为0.72%，（G＋C）含量60.4%；petB/petD序列总长616bp，仅1处变异位点和2种单倍型，变异位点百分率为0.16%，（G＋C）含量34.6%。表明山丹中，petB/petD区域较ITS序列保守，变异速率较慢。对ITS序列单倍型进行失配分布和中性检