【摘 要】
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Hi-C技术是一种测量整个基因组中所有成对交互的频率的技术,已成为研究基因组3D结构最流行的工具之一。通常情况下,基于Hi-C数据的研究需要测序大量的染色体数据,而测序深度
【基金项目】
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国家自然科学基金(61762089,91631305,61863036)
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Hi-C技术是一种测量整个基因组中所有成对交互的频率的技术,已成为研究基因组3D结构最流行的工具之一。通常情况下,基于Hi-C数据的研究需要测序大量的染色体数据,而测序深度较低的Hi-C数据虽然成本较低,但不足以提供充足的生物学信息给后续研究。由于Hi-C数据包含了类似的子模式,且一定区域内具有数据连续性,因此可以被预测。文中探究了基于卷积神经网络模型的改进方法,该模型以更大的范围预测核心的Hi-C数值,并扩展卷积神经网络的深度和感受野,通过1/16的原始测序读数,预测出Hi-C数据的原始测序读数。实验结
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