Generation and analysis of expressed sequence tags from the salt-tolerant eelgrass species, Zostera

• 作 者: KONG Fanna
• 机 构: CollegeofMarineLifeSciences,KeyLaboratoryofMarineBiologyGeneticsandBreedingofMinistryofEducation
• 出 处: 海洋学报：英文版
• 发表日期: 2013年8期
• 关键词: 表达序列标签 耐盐基因 金属硫蛋白基因 EST序列 物种 苦草 游艇码头 藻 expressed sequence tags （ESTs） gene func
• 基金项目: Foundation item： The Key Science and Technology Program of Shandong Province under contract No. 2012GHY11527, Natural Science Foundation of Shandong Province under contract No. Q2007E02, Specialized R

Zostera 系船池，单子叶植物的被子植物，是最重要的 seagrass 种类之一。调查咸忍耐的机制并且在 Z 发现盐容忍的基因。系船池，一个 cDNA 图书馆被构造。4 081 克隆的 5 结束的单个通行证的定序产出 4 002 个高质量的表示顺序标签(EST ) ，它被装配进 241 contigs 和 1 673 单条，代表 1 914 unigenes。EST 的平均长度是 582 bp，与从 1001 500 bp 的尺寸。基本本地排列搜索工具(BLASTX ) 分析表明 1 664 unig