【摘 要】
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通过下载国际一级序列数据库GenBank的序列数据,开发研制了真核生物基因内含子数据库EID,该数据库由一个主数据库和多个子数据库组成,子数据库包括细胞核内含子数据库、细胞
【机 构】
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中山大学生命科学学院,中山大学生命科学学院广东广州510275,广东广州510275,广东广州510275
【基金项目】
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国家自然科学基金资助项目(30270752),广东省自然科学基金资助项目(031616)
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通过下载国际一级序列数据库GenBank的序列数据,开发研制了真核生物基因内含子数据库EID,该数据库由一个主数据库和多个子数据库组成,子数据库包括细胞核内含子数据库、细胞器内含子数据库,以及植物、无脊椎动物、灵长类、啮齿类、其他哺乳类和其他脊椎动物等不同类型生物内含子数据库。文中详细介绍了数据的获取和筛选方法,主数据库中dEID,pEID,hEID的文件格式和结构,EID数据库构建程序,以及EID的查询方式,提供的分析工具等。EID将建设成为研究内含子功能和进化起源的生物信息学平台。
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