【摘 要】
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甘露聚糖酶基因在植物种子萌发、果实的成熟软化、植物器官的脱落以及非生物胁迫等过程发挥重要作用.为研究其在苎麻中的基因功能,本研究根据苎麻转录组测序中的BnMA N1片段
【机 构】
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湖南农业大学苎麻研究所,长沙,410128;湖南省种质资源创新与资源利用重点实验室,长沙,410128
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甘露聚糖酶基因在植物种子萌发、果实的成熟软化、植物器官的脱落以及非生物胁迫等过程发挥重要作用.为研究其在苎麻中的基因功能,本研究根据苎麻转录组测序中的BnMA N1片段序列,克隆该基因的cDNA全长及其上游的调控序列.生物信息学分析发现:BnMAN1基因上游的调控序列包括TATA-box、CAAT-box、AE-box、Box 4、Ⅰ-box、GAG-motif、GATA-motif、Skn-1 _motif、ARE、AuxRR-core、TCA-element、MBS等顺式作用元件.BnMAN1基因开放阅读框为1 128bp,编码375个氨基酸,预测其相对分子质量为42.47 kD,理论等电点为9.45.与桃树(ABV32548)、苦瓜(XP_022132624)、毛果杨(XP_006383170)、野生大豆(KHN36084)和橡胶树(XP_021678603)氨基酸序列相似性分别为82％、81％、79％、79％、76％.蛋白的二级结构中α-螺旋约占45.33％,延伸链约为15.20％,无规则卷曲约为39.47％.结构域分析发现具有COG3934、Cellulase结构域,属于β-甘露聚糖酶类.苎麻BnMAN1及其启动子将为今后对该基因在苎麻中的功能研究提供帮助.
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