【摘 要】
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[目的]利用生物信息学挖掘原发性肝癌中新的生物标志物.[方法]分析ONCOMINE数据库中197例中国原发性肝癌患者和76例正常样本中的差异表达基因.利用生物信息学手段筛选得到生物标志物,并验证其在临床样本中的表达.采用TCGA和R软件构建预后模型;通过STRING和DAVID数据库分析其共表达基因和生物功能.最后,利用GEPIA 2.0和TIMER 2.0数据库分析其与肿瘤免疫浸润的关系.[结果]筛选得到的前42个差异表达基因(P<1.69 E-89)中,Hub基因KPNA2和RRM2的过表达会造成原发
【机 构】
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湖北省十堰市太和医院(湖北医药学院附属医院)药学部,湖北十堰442000;湖北医药学院,湖北十堰442000
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[目的]利用生物信息学挖掘原发性肝癌中新的生物标志物.[方法]分析ONCOMINE数据库中197例中国原发性肝癌患者和76例正常样本中的差异表达基因.利用生物信息学手段筛选得到生物标志物,并验证其在临床样本中的表达.采用TCGA和R软件构建预后模型;通过STRING和DAVID数据库分析其共表达基因和生物功能.最后,利用GEPIA 2.0和TIMER 2.0数据库分析其与肿瘤免疫浸润的关系.[结果]筛选得到的前42个差异表达基因(P<1.69 E-89)中,Hub基因KPNA2和RRM2的过表达会造成原发性肝癌患者的生存预后不良,但RRM2不符合多因素Cox模型.C-index:0.803(0.746-1)可预测原发性肝癌患者1、3、5年生存预后率(P<0.01).二者可调控多条通路且与肿瘤免疫浸润显著相关(P<0.01).[结论]过表达的KPNA2能通过调控RNA的转运、谷胱甘肽的代谢和p53通路降低患者生存预后率且符合Cox模型(P<0.01),是一种新的原发性肝癌生物标志物.C-index:0.803 (0.746-1)可为临床预测患者1、3、5年生存预后率提供参考(P<0.01).有研究已验证KPNA2在原发性肝癌中的表达,这侧面证实了此结论的准确性.
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