家鸽粪便细菌多样性的高通量测序分析及其环境意义

• 作 者: 李传海 尚健 聂文芳 李立峰 曹慧
• 机 构: 南京农业大学生命科学学院/农业部农业环境微生物工程重点实验室,宣城市种植业局
• 出 处: 南京农业大学学报
• 发表日期: 2017年1期
• 关键词: 鸽粪 高通量钡4序 细菌多样性 致病性细菌 pigeon feces high-throughput sequencing bacterial diver

[目的]研究家鸽粪便细菌群落组成与结构特征，明确鸽粪中病原微生物主要类群，探究鸽粪微生物多样性与环境风险之间的关系。[方法]以规模化养殖场家鸽粪便为试验材料，采用Illumina MiSeq高通量测序方法分析了3个养殖场鸽粪（HP、WB和HH）细菌16SrDNA（V3V4）多样性及其环境意义。[结果]3个鸽粪样品共获得大约12万条有效序列，在Cutoff值为0．03水平上进行可操作分类单元（operational taxonomic unit，OTU）归类，HP、WB、HH分别有4215、3672和244