不同种植年限黄连根系土壤细菌PCR-DGGE分析

• 作 者: 谭渊 陈强 刘汉军 宋三多 余秀梅 董振寰 唐雪 钟宇舟
• 机 构: 四川农业大学资源学院,
• 出 处: 中国中药杂志
• 发表日期: 2015年16期
• 关键词: 黄连 细菌种群 根际土壤 16S rDNA PCR-DGGE

该研究应用PCR-DGGE技术,分析了不同种植年限正常生长、发病的黄连Coptis chinensis的根际和非根际土壤的细菌种群多样性指数,并选取代表性DGGE条带进行克隆测序,构建细菌系统发育树状图。结果表明,正常土样与发病土样土壤细菌种群差异明显,且发病土样多样性指数(H)高于正常土样;代表性条带克隆测序结果表明,黄连种植土壤中未培养细菌为优势菌群,其余类群为食酸菌属、芽孢杆菌属、不动杆菌属、未培养克吕沃尔菌属以及未培养丛毛单胞菌,未发现已报道的植物病原细菌。发病土样中Clone band d的谱带亮度高于正常土样,该条带菌株在分类上属于食酸菌属。显然,黄连种植过程中,根际土壤中细菌种群发生了改变,其中食酸菌属的细菌在发病根际土壤增加,很可能与黄连病害发生有关。