【摘 要】
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转录组测序可在各种环境条件下对物种进行高通量测序,通过基因结构分析和功能注释,探讨特定条件下相关基因的功能和表达情况。该研究分别获取低盐胁迫组(盐度0.2)和自然海水
【机 构】
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江苏海洋大学海洋生命与水产学院,连云港市农业农村局,中国水产科学研究院南海水产研究所
【基金项目】
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江苏省研究生科研与实践创新计划项目(SJCX18_0927),江苏省海洋生物技术重点实验室开放基金(HS16005),广东省渔业生态环境重点实验室开放基金(FEEL_2019_3),连云港市“海燕计划”
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转录组测序可在各种环境条件下对物种进行高通量测序,通过基因结构分析和功能注释,探讨特定条件下相关基因的功能和表达情况。该研究分别获取低盐胁迫组(盐度0.2)和自然海水组(盐度31)脊尾白虾(Exopalaemon carinicauda)样品,通过Illumina平台进行转录组测序,获得13.92 Gb高质量测序数据,组装得到111618条转录本和72734条Unigenes,其中有22879条Unigenes得到注释,比对到Nr数据库的Unigenes为21931条;筛选出1492条脊尾白虾低盐胁迫差异
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