【摘 要】
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目的 了解杭州市2008年和2011年肠道病毒71型( EV71)流行株VP1基因特征.方法 手足口病患者咽拭子、粪便等样本先通过荧光RT-PCR方法初筛,然后选部分肠道病毒71型阳性样本进行
【机 构】
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杭州市疾病预防控制中心,浙江杭州,310021
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目的 了解杭州市2008年和2011年肠道病毒71型( EV71)流行株VP1基因特征.方法 手足口病患者咽拭子、粪便等样本先通过荧光RT-PCR方法初筛,然后选部分肠道病毒71型阳性样本进行病毒分离、培养；通过逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)鉴定上述培养物,并扩增VP1区全长基因和序列测定,利用生物信息学软件对序列进行分析,构建基因进化树.结果 从2008年和2011年手足口样本中分离到EV71阳性毒株各4株,VP1基因全序列测定结果显示其与C4亚型代表株核苷酸和氨基酸的相似性最高,分别为93.8％～95.2％、99.0％～99.7％.结论 杭州市手足口病患者感染EV71病毒的流行株属C基因型的C4亚型.
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