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人类基因组计划的完成，标志着蛋白质组学研究的开始。蛋白质组学技术的发展为肺部感染性疾病常见病原体的研究提供了一个新的平台。目前，主要集中在发现新蛋白、病原菌致病机制、耐药机制的研究及菌种鉴定、疾病诊断和疫苗开发等几大领域，其意义在于指导临床医生早期明确诊断、治疗肺部感染性疾病，同时节约有限的卫生资源。