【摘 要】
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目的 运用生物信息学方法预测和分析结核分枝杆菌BfrA蛋白的结构和功能.方法 从NCBI数据库中检索基因Rv1876及其编码蛋白BfrA的基本信息,通过NCBI Blastp工具分析BfrA蛋白与人类蛋白的同源性,采用ProtParam、ProtScale、SOSUI、TMHMM、SignalP、TargetP、PSORT、Motif Scan、SOPMA、SWISS-MODEL、BepiPred、ABCpred、NetMHCⅡ、NetMHCⅡpan、NetCTL、SYFPEITHI和STRING生物信息
【机 构】
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大理大学基础医学院医学微生物与免疫学教研室,云南 大理671000
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目的 运用生物信息学方法预测和分析结核分枝杆菌BfrA蛋白的结构和功能.方法 从NCBI数据库中检索基因Rv1876及其编码蛋白BfrA的基本信息,通过NCBI Blastp工具分析BfrA蛋白与人类蛋白的同源性,采用ProtParam、ProtScale、SOSUI、TMHMM、SignalP、TargetP、PSORT、Motif Scan、SOPMA、SWISS-MODEL、BepiPred、ABCpred、NetMHCⅡ、NetMHCⅡpan、NetCTL、SYFPEITHI和STRING生物信息学在线软件预测及分析其理化性质、亲疏水性、可溶性、跨膜区、信号肽、亚细胞定位、翻译后修饰位点、二级结构、三级结构、B细胞及T细胞抗原表位、蛋白相互作用网络.结果 BfrA蛋白分子式为C802H1276N218O259S7,含有159个氨基酸,理论PI值为4.50,具有稳定性,是一种亲水性可溶性蛋白质;不具有信号肽和跨膜区域,是定位于细胞质的非分泌蛋白;BfrA蛋白二级结构包含α-螺旋(Hh)、β-转角(Tt)、无规则卷曲(Cc)、β-折叠(Ee);含有4个CK2-磷酸化位点、1个豆蔻酰化位点、3个PKC-磷酸化位点、1个TYR-磷酸化位点;该蛋白含有多个B细胞、Th细胞及CTL细胞抗原优势表位;与hemZ、mmcO、Rv1877、bfrB等蛋白形成相互作用网络.结论 通过生物信息学技术预测到BfrA蛋白具有多个B细胞及T细胞抗原表位,在结核病的预防和诊断方面具有应用前景.
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