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目的：比较蛋白质组研究的双向电泳中第一向（等电聚焦电泳）的杯上样法和溶涨上样法对2D图谱的影响。方法：以固相pH梯度等电聚焦为第一向和垂直SDS-PAGE为第二向，对上样方法及等电聚焦电泳程序及参数进行比较研究和条件优化。结果：在总电压时间积较短的情况下，运用杯上样法可以得到满意的图谱，而运用溶涨上样法却要在总电压时间积较长的情况下才能得到较好的图谱。结论：杯上样法和溶涨上样法均可得到满意的图谱，但杯上样法所需的总电压时间积比溶涨上样法要短。