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通过DNA微阵列和其他高效技术进行基因表达谱分析使得同时对一份生物标本中的所有基因进行研究成为可能，提供了健康或者病态组织转录状态的一个大概了解。尽管当前大多数的应用手段仍然着力于研究的方向：对疾病机制／涉及的信号途径、识别新的致癌基因／抑癌基因，这种技术的临床诊断性应用正在开始进入更规范的分子水平上的应用。