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结合傅立叶变换（ＦＴ）和主成份分析（ＰＣＡ）技术，实现了二维高效液相色谱数据的压缩和重构，并对不同信噪比的二维色谱测量数据进行了处理，即使对原始数据的压缩比高达２００倍，仍能很好地重构原始数据，当原始数据的信噪比较低时，阈值的选择受大振幅噪音的影响，使压缩比略有下降，但仍然能够保持信号基本不失真。