论文部分内容阅读
目的：确定O1群El Tor型霍乱弧菌N16961超级整合子（SI）中霍乱弧菌重复序列（VCR）的序列特点,以及VCR和基因盒的数量及位置。方法：用局部序列比对软件BLAST将VCR参考序列与霍乱弧菌N16961的Ⅱ号染色体进行比对,用Artemis Comparison Tool查看比对结果获得比对区域的位置信息,并采用perl语言脚本获得霍乱弧菌N16961的Ⅱ号染色体VCR相应区域的序列;用全局比对软件Clustal W将上一步获得的所有VCR序列进行多序列比对,采用perl语言脚本处理比对结果获得