【摘 要】
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油楠(Sindora glabra)作为极具开发潜力的能源植物,在分子水平上的研究仅局限于ISSR分子标记.本研究利用Trinity软件对油楠转录组数据进行组装,共得到总长为48 307 806 bp的2
【机 构】
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中国林业科学研究院热带林业研究所,热带林业研究国家林草局重点实验室,广州,510520
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油楠(Sindora glabra)作为极具开发潜力的能源植物,在分子水平上的研究仅局限于ISSR分子标记.本研究利用Trinity软件对油楠转录组数据进行组装,共得到总长为48 307 806 bp的283 998条Unigenes.利用MISA软件寻找到97 443个含有SSR的重复基元.SSR位点中主要重复序列为单核苷酸和二核苷酸,分别占总SSR位点的67.68％和22.56％,其次是三核苷酸,占8.54％.利用Primer 3.0设计引物,并从中随机选择200对引物进行PCR扩增,其中有13对扩增出清晰条带,多态性高,重复性好.油楠SSR分子标记的开发对于研究其遗传多样性、重要性状基因定位及分子标记辅助选择育种等起到重要的推动作用.
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