【摘 要】
：
目的 分析晚期胃癌(advanced gastric cancer,AGC)患者和早期胃癌(early gastric cancer,EGC)患者菌群的结构、组成,进一步确定胃癌进展相关的菌群特征.方法 本研究共纳入60例胃癌患者,黏膜标本取自于癌性病灶切缘>5 cm的正常胃黏膜组织.提取组织基因组DNA,采用高通量测序分析胃黏膜菌群,以EGC组菌群为对照,利用线性判别效应(linear discriminant analysis effect size,LEfSe)分析AGC组和EGC组菌群组成差异;采
【机 构】
：
大连医科大学附属青岛市市立医院中心实验室,山东 青岛 266071;青岛大学医学院附属青岛市市立医院检验科;青岛大学医学院附属青岛市市立医院中心实验室;大连医科大学附属青岛市市立医院中心实验室,山东
论文部分内容阅读
目的 分析晚期胃癌(advanced gastric cancer,AGC)患者和早期胃癌(early gastric cancer,EGC)患者菌群的结构、组成,进一步确定胃癌进展相关的菌群特征.方法 本研究共纳入60例胃癌患者,黏膜标本取自于癌性病灶切缘>5 cm的正常胃黏膜组织.提取组织基因组DNA,采用高通量测序分析胃黏膜菌群,以EGC组菌群为对照,利用线性判别效应(linear discriminant analysis effect size,LEfSe)分析AGC组和EGC组菌群组成差异;采用受试者工作特性曲线下面积-随机森林(optimizing the area under the re-ceiver operating characteristic curve of the random forest,AUC-RF)算法建立随机森林(random forest,RF)模型,对胃癌进展相关菌群特征进行分析.结果 EGC组菌群Shannon多样性指数为2.454,明显低于AGC组(2.673),差异有统计学意义(t=2.577,P=0.013),而Chao 1指数EGC组略高于AGC组,但差异无统计学意义(t=0.619,P=0.538).主成分分析(principal coordinate analysis,PCoA)结果发现两组患者胃菌群出现明显集中,并可以相互区分(P=0.04).LEfSe分析结果显示,LDA值≥2.0的细菌共12个属,分别为Thermus、Burkholderia、Pseudomonas、Brevibacillus、Stenotrophomonas、Salinivibrio、Uruburuella、Schlegelella、Bradyrhizobium、Nocar-dioides、Bacillus和Ochrobactrum.采用AUC-RF算法得到一个最优的24个细菌属组合能够最大限度地区分AGC组和EGC组(AUC=0.916,95％CI:0.841～0.990,灵敏性=0.800,特异性=0.767).结论 在胃癌进展过程中,胃菌群在组成及多样性方面发生明显改变,并发现了24个细菌属组合能够很好地区分AGC组和EGC组菌群,与胃癌进展密切相关.本研究从菌群角度为辅助临床判断胃癌进程,为探索胃癌进展相关的菌群变化提供新的理论依据和新路径.
其他文献
胃结肠瘘的发病率极低,且由胰腺癌导致的胃结肠瘘在临床上更是罕见.现通过1例胃结肠瘘的病例分析,结合国内外文献的学习,进一步学习胃肠瘘的病因、临床表现、诊断以及治疗,以期提高临床医师对该病的认识.
目的 探讨 α2A肾上腺素能受体(ADRA2A)-1291C>G和胆囊收缩素受体1(CCK1R)-779T>C的多态性与肠易激综合征(irritable bowel syndrome,IBS)的关系.方法 利用PubMed、Embase、ISI科学网和万方数据库的在线网站,在不限制语言的情况下,检索1996年6月至2019年5月的相关文献.结果 ADRA2A-1291C>G的C等位基因和CCK1R-779T>C的T等位基因与IBS发病风险的增加密切相关.亚组分析表明,ADRA2A-1291C>G增加了显性
目的 检测疣状胃炎组织中人巨细胞病毒(HCMV)的表达,探讨其与疣状胃炎病理特征及幽门螺旋杆菌(H.pylori)的关系.方法 选取就诊于西安市第一医院消化内科经内镜诊断为疣状胃炎患者80例(研究组)及慢性浅表性胃炎患者70例(对照组)为研究对象,采用免疫组化SP法对病理标本进行HCMV的检测并观察HCMV表达情况,并进一步将研究组根据H.pylori感染情况分为H.pylori阳性组和H.pylori阴性组,观察HCMV的表达情况及其病理特征.结果 研究组组织中HCMV表达阳性率(35.0％)高于对照组
目的 观察非糜烂性反流病(non-erosive reflux disease,NERD)患者食管黏膜肥大细胞(mast cells,MCs)表达情况及与瞬时感受器电位香草酸受体1(transient receptor potential vanilloid 1,TRPV1)表达的相关性,以阐明MCs增殖活化对于NERD食管黏膜外周神经敏感受体的影响.方法 通过HE染色、甲苯胺蓝染色、免疫组化、免疫荧光方法观察15例NERD患者及15名健康对照者MCs及TRPV1的表达.结果 与健康对照组比较,NERD组
疝和腹壁外科是近20年来发展较快的外科分支之一.疝病是基本外科的常见疾病.手术技术及修复材料的进展,大大推动了该专业的发展.20世纪90年代初,黎介寿等率先向国内介绍了疝和腹壁外科的新进展,即无张力疝修复技术[1-2].1997年,马颂章将网塞-平片技术(Robbins-Rutkow技术)引进中国,无张力疝修补术在我国广泛开展.我国疝和腹壁外科进入快速发展时期.
目的 探讨伴有消化道出血的胃肠间质瘤患者的危险因素及预后.方法 对241例胃肠间质瘤患者进行回顾性分析,根据是否合并消化道出血分为两组,分析两组患者的临床病理特点、实验室检查、预后.结果 单因素分析显示:消化道出血组的性别、T分期、M分期、肿瘤部位、Ki-67、危险度分级与未出血组相比,差异有统计学意义(P<0.05).Logistic回归分析显示:Ki-67(OR=2.170,95％CI:1.236～5.043)、T分期(OR=1.773,95％CI:1.101～2.854)及肿瘤部位(OR=0.168
胰腺癌是我国常见的恶性肿瘤之一,具有发病隐匿、侵袭性强、预后极差、死亡率高等特点,严重威胁着人类的生命健康.胰腺导管腺癌是其主要的病理类型.随着分子生物学与基因组学的不断发展,长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)在胰腺癌病理生理过程中的作用越来越受到重视.本文就近年来lncRNA在胰腺癌中介导的细胞增殖与凋亡、上皮间充质转化(epithelial-mesenchymal transition,EMT)、迁移与侵袭、维持肿瘤干细胞特性、化疗耐药等生物学行为以及预后的国内外
目的 观察吴茱萸碱对胃癌BGC-823细胞系增殖、迁移、侵袭的作用,并探讨其通过微小RNA(miRNA)-143-3p/成纤维细胞生长因子1(FGF1)信号轴的调控机制.方法 取对数期BGC-823细胞随机分为对照组、吴茱萸碱低剂量组、吴茱萸碱中剂量组、吴茱萸碱高剂量组,分别用终浓度为0、2、4、8μmol/L吴茱萸碱进行干预,采用MTT比色法检测干预24、48、72 h时细胞增殖情况,采用划痕实验和Transwell实验检测干预24 h时细胞迁移率和穿膜细胞数,采用qRT-PCR法和Western bl
目的 探讨慢加急性肝衰竭(acute-on-chronic liver failure,ACLF)患者血清中IL-34、IL-12P70的表达及临床意义.方法 采用酶联免疫吸附试验检测55例ACLF患者(肝衰竭组)及40名健康体检者(对照组)血清中IL-34、IL-12P70水平.随访12周肝衰竭患者的生存情况并分为好转组(n=35)、死亡组(n=20),检测并比较两组IL-34、IL-12P70水平.进一步采用Pearson相关性检验分析ACLF患者血清中IL-34、IL-12P70水平与PTA、MEI
目的 了解河南省13 C呼气试验结果阳性的患者中分离的幽门螺杆菌(H.pylori)对利福昔明的药物敏感性及其他6种常用抗菌素(克拉霉素、左氧氟沙星、呋喃唑酮、四环素、甲硝唑、阿莫西林)的耐药情况,以掌握河南省H.pylori对上述抗菌素的药敏谱,指导临床用药.方法 选取2019年4月至2019年12月在我院行13 C-快速尿素酶呼气试验检查(13 C-UBT)且结果为H.pylori阳性的河南省患者为本次研究对象.常规胃镜操作下取胃黏膜组织样本,送我院H.pylori实验室培养鉴定,获得H.pylori