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由于科学技术的发展，囊虫病免疫诊断检测方法有了很大的进展，主要有1．免疫学检测方法，包括酶联免疫吸附法（ELISA）、斑点酶联免疫吸附法（Dot-ELISA）、生物素-亲和素酶联免疫吸附法（BAS-ELISA）、单克隆抗体酶联免疫吸附试验（McAb-ELISA）、酶联免疫印渍技术（ELIB）；2．基因检测技术，包括DIG标记DNA探针、细胞因子基因检测方法、基因重组技术；3．免疫试剂盒的应用，包括循环抗原酶联免疫试剂盒、猪囊虫短程抗体IgG4快速ELISA检测试剂盒等。