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人类基因组计划的完成，宣告了后基因组时代的到来，基因功能成为生命科学研究重点。蛋白作为重要的生物大分子，是基因功能的执行体，在参与细胞赖以生存的代谢和调控途径中，比DNA和RNA发挥着更加直接的作用。蛋白质作为功能上最重要的生物分子，参与所有的生物学过程，含有大量的生物学信息。除此以外，蛋白由氨基酸序列决定，它的性质是描述生物系统的关键，包括表达量、特殊活性、修饰状态和与其他蛋白或不同类型分子的联系等等。因此蛋白质组研究已成为21世纪生命科学发展的先导，