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新疆色勒特果勒铜钼矿床是形成于晚古生代准噶尔洋向伊犁板块俯冲环境中的斑岩-矽卡岩型矿床。矿体主要产于闪长斑岩、石英闪长斑岩和斑岩体与围岩的接触带矽卡岩中。矿区发育大量的磁黄铁矿，未见原生的磁铁矿、赤铁矿以及石膏等高氧逸度矿物。矿区内的矽卡岩呈层状、似层状产在石炭系东图津河组中。石榴子石在矽卡岩中大量发育，是矽卡岩中最主要的造岩矿物，根据其颜色和形态的变化，主要可以分为3类：① 内矽卡岩及岩体中的红色石榴子石；② 岩体与灰岩接触带矽卡岩中的棕色石榴子石；③ 靠近灰岩的灰绿色石榴子石。流体包裹体激光拉曼分析结