【摘 要】
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目的 运用网络药理学方法探究七味都气丸治疗慢性阻塞性肺疾病(COPD)的作用机制及信号通路预测.方法 运用TCMSP数据库搜索七味都气丸中药物的有效成分,筛选符合条件的靶标.通过GeneCards数据库搜索COPD相关基因信息,运用R语言、Activeperl 5.28.1进行药物与疾病基因的合并,得到重合的基因,运用Cytoscape软件对药物、化合物、重合基因靶点、疾病进行中药-化合物-靶点-疾病网络(network)的构建及进行可视化分析.将重合基因导入String在线数据库进行蛋白间互作关系分析,
【机 构】
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辽宁中医药大学,辽宁 沈阳 110032;辽宁中医药大学附属医院,辽宁 沈阳110032
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目的 运用网络药理学方法探究七味都气丸治疗慢性阻塞性肺疾病(COPD)的作用机制及信号通路预测.方法 运用TCMSP数据库搜索七味都气丸中药物的有效成分,筛选符合条件的靶标.通过GeneCards数据库搜索COPD相关基因信息,运用R语言、Activeperl 5.28.1进行药物与疾病基因的合并,得到重合的基因,运用Cytoscape软件对药物、化合物、重合基因靶点、疾病进行中药-化合物-靶点-疾病网络(network)的构建及进行可视化分析.将重合基因导入String在线数据库进行蛋白间互作关系分析,得到蛋白间相互作用(PPI)网络.运用R语言,利用biocon-ductor数据库对得到的共同靶点进行GO和KEGG富集分析,得到富集结果及信号通路信息.最后运用Cytoscape软件对重合基因靶点与所得到的信号通路信息进行网络构建,得到靶点-通路网络图.结果 从七味都气丸中筛选出81种有效成分,共102个靶点信息,COPD相关基因5971个,两者重合基因为89个,network显示槲皮素、豆甾醇、山柰酚、β-谷固醇、谷甾醇等为七味都气丸治疗COPD重要的化合物,蛋白互作结果得出IL6、CASP3、VEGFA、MAPK8、EGFR、MYC等为发挥作用的蛋白物质;从靶点与信号通路网络图中得知,RAF1、RELA、MAPK8、IKBKB、PRKCA、NFK-BIA、GSK3 B、EGFR、CCND1、FOS、BCL2、IL6等作为七味都气丸治疗COPD的核心靶点,并通过PI3 K-Akt信号通路、TNF信号通路等发挥作用.结论 七味都气丸通过其中的有效活性成分槲皮素、豆甾醇、山柰酚、β-谷固醇、谷甾醇等,并通过RAF1、RELA、MAPK8、IKBKB、PRKCA、IL6等靶点,调控PI3 K-Akt、TNF等相关信号通路及细胞凋亡等生理过程,从而减轻气道炎症,调节免疫功能,抑制对肺实质的损害,达到治疗COPD的目的.
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