黄瓜叶绿体基因组全序列微卫星分布特征与标记开发

• 作 者: 胡建斌 李建吾 梁芳芳 刘颖
• 机 构: 河南农业大学园艺学院
• 出 处: 细胞生物学杂志
• 发表日期: 2009年1期
• 关键词: 黄瓜 叶绿体基因组 微卫星 标记 cucumber （Cucumis sativus） chloroplast genome microsatellites

对黄瓜叶绿体基因组（chloroplast genomic DNA，cpDNA）全序列中微卫星（chloroplast simple sequence repeat，cpSSR）的分布特征进行了全面分析。结果发现，cpSSR主要分布在25,40kb和100—130kb两个区域，主要以完全重复和间隔重复为主。单碱基重复最多，占总数的79.3％，二碱基重复占10．1％，三碱基和三碱基以上重复仅占10．6％。单碱基重复主要以（A）。和（T）n为主，二者共占总数的78．8％，二碱基重复主要是（AT）a，占总数的9