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根据中国科学技术信息研究所2009年11月27日公布的2008年度中国科技论文统计结果,上海交通大学医学学科被SCI收录论文645篇,比上年度增长34.7%（2007年为421篇,名列第二位）,首次名列全国高校第一位;浙江大学（569篇）和北京大学（491篇）分别列第二位和第三位。SCI收录论文全国医疗机构前20位排名中,附属瑞金医院（169篇）、第六人民医院（115篇）、第九人民医院（90篇）分列第7、12、17位。