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乙型肝炎病毒在一定的选择压力下，由于其具有的一些特征，导致比其他DNA病毒更易出现变异。前C区和基本核心启动子（BCP）的变异可产生HBeAg阴性变异株；前S／S区的基因变异可导致HBsAg的漏检；BCP突变和前S缺失突变可增加肝细胞癌的发生概率；P基因变异主要见于耐药性突变；X基因的变异与肝脏癌变形成相关。对于突变株的检测应采用一定的选择策略。